دوره 8، شماره 1 - ( بهار و تابستان 1403 )
جلد 8 شماره 1 صفحات 63-55 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Piryaei F. Identification of Likely Novel piRNA Sequences in Human Testis Tissue and Bioinformatics Analysis. J Res Urol 2024; 8 (1) :55-63
URL: http://urology.umsha.ac.ir/article-1-172-fa.html
URL: http://urology.umsha.ac.ir/article-1-172-fa.html
پیریائی فهیمه. شناسایی توالی‌های جدید piRNA احتمالی در بافت بیضه‌ی انسان و تجزیهوتحلیل بیوانفورماتیکی. مجله تحقیقات در ارولوژی. 1403; 8 (1) :55-63
مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، پژوهشکده سرطان، پژوهشگاه تحقیقات سلامت ابن‌سینا، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران & گروه ژنتیک پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران ، f.piryaei@umsha.ac.ir
چکیده: (802 مشاهده)
سابقه و هدف: : RNAهای کوچک غیرکدکننده (sncRNAها) در سیستم تولیدمثلی مردان مطالعه شده‌اند. یکی از مهم‌ترین RNAهای کوچک (sRNA) مورد مطالعه در اسپرم‌زایی، piRNAها هستند. در این مطالعه، تجزیهوتحلیل جامع و مقایسه‌ی پروفایل بیان توالی‌های sRNA جدید، که حدس زده می‌شود piRNA باشند، در بافت بیضه‌ی مردان جهت شناسایی توالی‌های sRNA جدید انجام شده است.
مواد و روش‌ها: جهت کشف توالی‌های جدید، از مجموعه‌ی داده‌ی GSE248576 در NCBI-GEO استفاده شد. سپس، با ابزار میراندا (Miranda) ژن‌های هدف بالقوه برای توالی‌های کشف‌شده پیشگویی شد. درنهایت، با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، مسیرهای تنظیمی مرتبط با اسپرماتوژنز به دست آمد.
یافته‌ها: در این مطالعه، 208 عدد توالی sRNA جدید به‌مثابه‌ی piRNA که تاکنون در پایگاه داده‌های مربوط به توالی‌های کوچک گزارش نشده‌اند در بافت بیضه‌ی مردان شناسایی شد؛ در تجزیهوتحلیل آنتولوژی ژن، مسیرهای KEGG و Reactome و تجزیهوتحلیل برهمکنش پروتئین - پروتئین، ترم‌های (terms) مرتبط با فرایندهای تنظیمی میتوز و میوز و رشد سلولی در گامتوژنز مشخص شد.
نتیجه‌گیری: توالی‌های sRNA جدید یافته‌شده و ژن‌های پیشگویی‌شده‌ی هدف آن‌ها، در این مطالعه می‌توانند کاندیدهای امیدبخشی جهت بررسی نقش آن‌ها در اسپرماتوژنز اختلال‌یافته به‌مثابه‌ی یک فنوتیپ ناباروری در مردان باشند.
مواد و روش‌ها: جهت کشف توالی‌های جدید، از مجموعه‌ی داده‌ی GSE248576 در NCBI-GEO استفاده شد. سپس، با ابزار میراندا (Miranda) ژن‌های هدف بالقوه برای توالی‌های کشف‌شده پیشگویی شد. درنهایت، با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، مسیرهای تنظیمی مرتبط با اسپرماتوژنز به دست آمد.
یافته‌ها: در این مطالعه، 208 عدد توالی sRNA جدید به‌مثابه‌ی piRNA که تاکنون در پایگاه داده‌های مربوط به توالی‌های کوچک گزارش نشده‌اند در بافت بیضه‌ی مردان شناسایی شد؛ در تجزیهوتحلیل آنتولوژی ژن، مسیرهای KEGG و Reactome و تجزیهوتحلیل برهمکنش پروتئین - پروتئین، ترم‌های (terms) مرتبط با فرایندهای تنظیمی میتوز و میوز و رشد سلولی در گامتوژنز مشخص شد.
نتیجه‌گیری: توالی‌های sRNA جدید یافته‌شده و ژن‌های پیشگویی‌شده‌ی هدف آن‌ها، در این مطالعه می‌توانند کاندیدهای امیدبخشی جهت بررسی نقش آن‌ها در اسپرماتوژنز اختلال‌یافته به‌مثابه‌ی یک فنوتیپ ناباروری در مردان باشند.
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
حق تالیف (کپی رایت) برای مولفان محفوظ است.
صاحب امتیاز: دانشگاه علوم پزشکی همدانناشر: انتشارات دانشگاه علوم پزشکی همدان
شماره تماس مجله: 08138380283
شماره تماس ناشر: 08138380548
ایمیل: urology[at]umsha.ac.ir
