دوره 8، شماره 1 - ( بهار و تابستان 1403 )
جلد 8 شماره 1 صفحات 44-36 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Taherkhani A, Mohseni M. Identification of Signaling Pathways and Prognostic Biomarkers in Prostate Cancer using Bioinformatics Approaches. J Res Urol 2024; 8 (1) :36-44
URL: http://urology.umsha.ac.ir/article-1-164-fa.html
URL: http://urology.umsha.ac.ir/article-1-164-fa.html
طاهرخانی امیر، محسنی مائده. شناسایی مسیرهای سیگنالینگ و بیومارکرهای پیشآگهیدهنده در سرطان پروستات با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیک. مجله تحقیقات در ارولوژی. 1403; 8 (1) :36-44
امیر طاهرخانی1 
، مائده محسنی*2
، مائده محسنی*2
1- مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، پژوهشکده سرطان، پژوهشگاه سلامت ابنسینا، دانشگاه علومپزشکی همدان، همدان، ایران،
2- مرکز تحقیقات اورولوژی و نفرولوژی، پژوهشکده علوم بالینی ابنسینا، پژوهشگاه سلامت ابنسینا، دانشگاه علومپزشکی همدان، همدان، ایران ،mao.mohseni@gmail.com
2- مرکز تحقیقات اورولوژی و نفرولوژی، پژوهشکده علوم بالینی ابنسینا، پژوهشگاه سلامت ابنسینا، دانشگاه علومپزشکی همدان، همدان، ایران ،
چکیده: (610 مشاهده)
سابقه و هدف: سرطان پروستات یکی از شایع‌ترین سرطان‌ها در مردان است و در سال 2022 با 1,466,680 مورد جدید، چهارمین سرطان ازنظر فراوانی گزارش شد. این مطالعه به بررسی بیان ژن‌های افتراقی و شناسایی نشانگرهای پیشآگهیدهنده در سرطان پروستات می‌پردازد. اهداف اصلی این تحقیق شامل شناسایی ژن‌های افتراقی در سرطان پروستات، تعیین فرایندهای زیستی و مسیرهای سیگنالینگ مرتبط با تومورزایی و نشان دادن ژن‌های مرتبط با پیش‌آگهی ضعیف در بیماران مبتلا به این بیماری است.
مواد و روش‌‌ها: این مطالعه از روش‌های بیوانفورماتیک به‌منظور آنالیز مجموعه‌داده توالی‌یابی RNA (RNA-Sequencing) با کد شناسه GSE104131 استفاده کرد. نمونه‌های تومور پروستات با درجه بالا و نمونه‌های بافت سالم مجاور از 16 بیمار جمع‌آوری شدند. ژن‌های افتراقی با استفاده از ابزار GEO2R شناسایی شدند. همچنین، شبکه برهم‌کنش پروتئین- پروتئین برای شناسایی ژن‌های هاب و بررسی نقش آن‌ها در پیش‌آگهی بیماران انجام شد.
یافته‌ها: نتایج نشان داد که 534 ژن افتراقی شناسایی شدند که ازاین‌بین تعداد 320 ژن افزایش‌یافته و 214 ژن کاهش‌یافته بودند. تحلیل‌ها نشان داد که افزایش بیان ژن‌های GATA6 و ABCC4 با پیش‌آگهی ضعیف در بیماران مبتلا به آدنوکارسینوم پروستات مرتبط است. همچنین، مسیرهای سیگنالینگ مانند «اکسیداسیون زیستی» و «ترشح انسولین» به‌طور معناداری در پیشرفت سرطان پروستات دخیل بودند.
نتیجه‌گیری: افزایش هم‌زمان بیان GATA6 و ABCC4 می‌تواند به‌عنوان نشانگرهای کلیدی برای پیش‌بینی نتایج نامطلوب در بیماران عمل کند. هدف‌گذاری بر روی این ژن‌ها و مسیرهای مرتبط ممکن است راهکارهای درمانی جدیدی برای مدیریت سرطان پروستات ارائه دهد.
مواد و روش‌‌ها: این مطالعه از روش‌های بیوانفورماتیک به‌منظور آنالیز مجموعه‌داده توالی‌یابی RNA (RNA-Sequencing) با کد شناسه GSE104131 استفاده کرد. نمونه‌های تومور پروستات با درجه بالا و نمونه‌های بافت سالم مجاور از 16 بیمار جمع‌آوری شدند. ژن‌های افتراقی با استفاده از ابزار GEO2R شناسایی شدند. همچنین، شبکه برهم‌کنش پروتئین- پروتئین برای شناسایی ژن‌های هاب و بررسی نقش آن‌ها در پیش‌آگهی بیماران انجام شد.
یافته‌ها: نتایج نشان داد که 534 ژن افتراقی شناسایی شدند که ازاین‌بین تعداد 320 ژن افزایش‌یافته و 214 ژن کاهش‌یافته بودند. تحلیل‌ها نشان داد که افزایش بیان ژن‌های GATA6 و ABCC4 با پیش‌آگهی ضعیف در بیماران مبتلا به آدنوکارسینوم پروستات مرتبط است. همچنین، مسیرهای سیگنالینگ مانند «اکسیداسیون زیستی» و «ترشح انسولین» به‌طور معناداری در پیشرفت سرطان پروستات دخیل بودند.
نتیجه‌گیری: افزایش هم‌زمان بیان GATA6 و ABCC4 می‌تواند به‌عنوان نشانگرهای کلیدی برای پیش‌بینی نتایج نامطلوب در بیماران عمل کند. هدف‌گذاری بر روی این ژن‌ها و مسیرهای مرتبط ممکن است راهکارهای درمانی جدیدی برای مدیریت سرطان پروستات ارائه دهد.
نوع مطالعه: پژوهشي |
موضوع مقاله:
سرطان اورولوژیک
دریافت: 1403/9/16 | پذیرش: 1403/9/23 | انتشار: 1403/6/10
دریافت: 1403/9/16 | پذیرش: 1403/9/23 | انتشار: 1403/6/10
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
حق تالیف (کپی رایت) برای مولفان محفوظ است.
صاحب امتیاز: دانشگاه علوم پزشکی همدانناشر: انتشارات دانشگاه علوم پزشکی همدان
شماره تماس مجله: 08138380283
شماره تماس ناشر: 08138380548
ایمیل: urology[at]umsha.ac.ir
