fa شناسایی توالی‌های جدید piRNA احتمالی در بافت بیضه‌ی انسان و تجزیه‌و‌تحلیل بیوانفورماتیکی آندرولوژی Andrology پژوهشي Research <div class="rounded" style="background: rgb(255, 218, 224); border: 1px solid rgb(250, 115, 115); padding: 5px 10px; text-align: justify;"><span style="line-height:2;"><span style="font-size:14px;"><span style="font-family:Tahoma;"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span lang="AR-SA"><span style="color:#fe2e9a"><span style="position:relative"><span style="top:-1.0pt"><span style="letter-spacing:-.1pt">سابقه و هدف:</span></span></span></span></span></b>&nbsp;<span lang="FA">: </span><span dir="LTR">RNA</span><span lang="FA">های کوچک غیرکدکننده (</span><span dir="LTR">sncRNA</span><span lang="FA">ها) در سیستم تولیدمثلی مردان مطالعه</span> <span lang="FA">شده‌اند. یکی از مهم‌ترین </span><span dir="LTR">RNA</span><span lang="FA">های کوچک (</span><span dir="LTR">sRNA</span><span lang="FA">) مورد مطالعه در اسپرم‌زایی، </span><span dir="LTR">piRNA</span><span lang="FA">ها هستند. در این مطالعه، تجزیه‌وتحلیل جامع و مقایسه‌ی پروفایل بیان توالی‌های </span><span dir="LTR">sRNA</span> <span lang="FA">جدید، که حدس زده می‌شود </span><span dir="LTR">piRNA</span> <span lang="FA">باشند، در بافت بیضه‌ی مردان جهت شناسایی توالی‌های </span><span dir="LTR">sRNA</span> <span lang="FA">جدید انجام شده است.</span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"></span></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span lang="AR-SA"><span style="color:#fe2e9a"><span style="position:relative"><span style="top:-1.0pt"><span style="letter-spacing:-.1pt">مواد و روش‌ها:</span></span></span></span></span></b><span lang="FA">&nbsp;جهت کشف توالی‌های جدید، از مجموعه‌ی داده‌ی </span><span dir="LTR">GSE248576</span> <span lang="FA">در </span><span dir="LTR">NCBI-GEO</span> <span lang="FA">استفاده شد. سپس، با ابزار میراندا (</span><span dir="LTR">Miranda</span><span lang="FA">) ژن‌های هدف بالقوه برای توالی‌های کشف‌شده پیشگویی شد. درنهایت، با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، مسیرهای تنظیمی مرتبط با اسپرماتوژنز به دست آمد. </span></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span lang="AR-SA"><span style="color:#fe2e9a"><span style="position:relative"><span style="top:-1.0pt"><span style="letter-spacing:-.1pt">یافته‌ها:</span></span></span></span></span></b><span lang="FA">&nbsp;در این مطالعه، 208 عدد توالی </span><span dir="LTR">sRNA</span> <span lang="FA">جدید به‌مثابه‌ی </span><span dir="LTR">piRNA</span> <span lang="FA">که تاکنون در پایگاه داده‌های مربوط به توالی‌های کوچک گزارش نشده‌اند در بافت بیضه‌ی مردان شناسایی شد؛ در </span><span lang="AR-SA">تجزیه‌و‌تحلیل آنتولوژی ژن، </span><span lang="FA">مسیرهای </span><span dir="LTR">KEGG</span> <span lang="FA">و </span><span dir="LTR">Reactome</span> <span lang="FA">و تجزیه‌و‌تحلیل برهمکنش پروتئین _- پروتئین، </span><span lang="AR-SA">ترم‌های (</span><span dir="LTR">terms</span><span lang="AR-SA">) مرتبط با فرایندهای تنظیمی میتوز و میوز و رشد سلولی در گامتوژنز مشخص شد.</span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"></span></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span lang="AR-SA"><span style="color:#fe2e9a"><span style="position:relative"><span style="top:-1.0pt"><span style="letter-spacing:-.1pt">نتیجه‌گیری:</span></span></span></span></span></b><span lang="FA">&nbsp;توالی‌های </span><span dir="LTR">sRNA</span> <span lang="FA">جدید یافته‌شده و ژن‌های پیشگویی‌شده‌ی هدف آن‌ها، در این مطالعه می‌توانند کاندیدهای امیدبخشی جهت بررسی نقش آن‌ها در اسپرماتوژنز اختلال‌یافته به‌مثابه‌ی یک فنوتیپ ناباروری در مردان باشند.</span></span></span></span></span></span></span></div> <div class="rounded" style="background: rgb(255, 218, 224); border: 1px solid rgb(250, 115, 115); padding: 5px 10px; text-align: justify;"><span style="line-height:2;"><span style="font-size:14px;"><span style="font-family:Tahoma;"><span style="unicode-bidi:embed"><b><span style="color:#fe2e9a"><span style="letter-spacing:.15pt">Background and Objective:</span></span></b> <span style="color:#1f1f1f">Small non-coding RNAs (sncRNAs) have been studied in the male reproductive system. One of the most important small RNAs (sRNAs) investigated in spermatogenesis is piRNA. This study performed a comprehensive analysis and comparison of the expression profiles of novel sRNA sequences, which are predicted to be piRNAs, in male testicular tissue. </span></span><br> <span style="unicode-bidi:embed"><b><span style="color:#fe2e9a"><span style="letter-spacing:-.2pt">Materials and Methods:</span></span></b> <span style="color:#1f1f1f">The GSE248576 dataset in NCBI-GEO was used to discover novel sequences. Subsequently, potential target genes of the discovered sequences were predicted using the Miranda tool. Finally, regulatory pathways related to spermatogenesis were obtained using bioinformatics tools.</span></span><br> <span style="unicode-bidi:embed"><b><span style="color:#fe2e9a"><span style="letter-spacing:-.2pt">Results:</span></span></b> <span style="color:#1f1f1f">In this study, 208 novel sRNA sequences were identified as piRNAs in male testicular tissue that have not been reported in small sequence databases so far. KEGG and Reactome pathways, protein-protein interaction analysis, significant terms related to the regulatory processes of mitosis and meiosis, and cell growth in gametogenesis were identified in the gene ontology analysis. </span></span><br> <span style="unicode-bidi:embed"><b><span style="color:#fe2e9a"><span style="letter-spacing:-.1pt">Conclusion:</span></span></b> <span style="color:#1f1f1f">The newly found sRNA sequences and their predicted target genes in this study could be promising candidates for investigating their role in impaired spermatogenesis as an infertility phenotype in men.</span></span></span></span></span></div> RNA کوچک غیرکدکننده, piRNA, اسپرماتوژنز, ناباروری Infertility, piRNA, Small Non-Coding RNA, Spermatogenesis 55 63 http://urology.umsha.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3563-1&slc_lang=fa&sid=1 Fahimeh Piryaei فهیمه پیریائی f.piryaei@umsha.ac.ir 10031947532846004476 10031947532846004476 Yes Research Center for Molecular Medicine, Institute of Cancer, Avicenna Health Research Institute, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، پژوهشکده سرطان، پژوهشگاه تحقیقات سلامت ابن‌سینا، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران