fa شناسایی مسیرهای سیگنالینگ و بیومارکرهای پیش آگهی دهنده در سرطان پروستات با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیک سرطان اورولوژیک Urologic oncology پژوهشي Research <div class="rounded" style="background: rgb(255, 218, 224); border: 1px solid rgb(250, 115, 115); padding: 5px 10px; text-align: justify;"><span style="font-size:14px;"><span style="font-family:Tahoma;"><span style="line-height:2;"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span lang="AR-SA"><span style="color:#fe2e9a"><span style="position:relative"><span style="top:-1.0pt"><span style="letter-spacing:-.1pt">سابقه و هدف:</span></span></span></span></span></b>&nbsp;<span lang="AR-SA">سرطان پروستات یکی از شایع‌ترین سرطان‌ها در مردان است و در سال 2022 با 1,466,680 مورد جدید، چهارمین سرطان ازنظر فراوانی گزارش شد</span><span lang="FA">. </span><span lang="AR-SA">این مطالعه به بررسی بیان ژن‌های افتراقی و شناسایی نشانگرهای پیش‌آگهی‌دهنده در سرطان پروستات می‌پردازد. اهداف اصلی این تحقیق شامل شناسایی ژن‌های افتراقی در سرطان پروستات، تعیین فرایندهای زیستی و مسیرهای سیگنالینگ مرتبط با تومورزایی و نشان دادن ژن‌های مرتبط با پیش‌آگهی ضعیف در بیماران مبتلا به این بیماری است. </span></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span lang="AR-SA"><span style="color:#fe2e9a"><span style="position:relative"><span style="top:-1.0pt"><span style="letter-spacing:.1pt">مواد و روش‌‌ها:</span></span></span></span></span></b>&nbsp;<span lang="AR-SA">این مطالعه از روش‌های بیوانفورماتیک به‌منظور آنالیز مجموعه‌داده‌ توالی‌یابی </span><span dir="LTR">RNA</span> <span lang="FA">(</span><span dir="LTR">RNA</span><span dir="LTR">-</span><span dir="LTR">Sequencing</span><span lang="FA">) با کد شناسه</span> <span dir="LTR">GSE104131</span> <span lang="AR-SA">استفاده کرد. نمونه‌های تومور پروستات با درجه بالا و نمونه‌های بافت سالم مجاور از 16 بیمار جمع‌آوری شدند. ژن‌های افتراقی با استفاده از ابزار </span><span dir="LTR">GEO2R</span> <span lang="AR-SA">شناسایی شدند. همچنین، شبکه برهم‌کنش پروتئین- پروتئین برای شناسایی ژن‌های هاب و بررسی نقش آن‌ها در پیش‌آگهی بیماران انجام شد.</span><b> </b><b><span lang="FA"><span style="font-family:"B Nazanin""></span></span></b></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span lang="AR-SA"><span style="color:#fe2e9a"><span style="position:relative"><span style="top:-1.0pt"><span style="letter-spacing:.1pt">یافته‌ها:</span></span></span></span></span></b><b>&nbsp;</b><span lang="AR-SA">نتایج نشان داد که 534 ژن افتراقی شناسایی شدند که ازاین‌بین تعداد 320 ژن افزایش‌یافته و 214 ژن کاهش‌یافته بودند. تحلیل‌ها نشان داد که افزایش بیان ژن‌های </span><span dir="LTR">GATA6</span> <span lang="AR-SA">و </span><span dir="LTR">ABCC4</span> <span lang="AR-SA">با پیش‌آگهی ضعیف‌ در بیماران مبتلا به آدنوکارسینوم پروستات مرتبط است. همچنین، مسیرهای سیگنالینگ مانند &laquo;اکسیداسیون زیستی&raquo; و &laquo;ترشح انسولین&raquo; به‌طور معناداری در پیشرفت سرطان پروستات دخیل بودند.</span><b> </b><b><span lang="FA"><span style="font-family:"B Nazanin""></span></span></b></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span lang="AR-SA"><span style="color:#fe2e9a"><span style="position:relative"><span style="top:-1.0pt"><span style="letter-spacing:.1pt">نتیجه‌گیری: </span></span></span></span></span></b><span lang="AR-SA">افزایش هم‌زمان بیان </span><span dir="LTR">GATA6</span> <span lang="AR-SA">و </span><span dir="LTR">ABCC4</span> <span lang="AR-SA">می‌تواند به‌عنوان نشانگرهای کلیدی برای پیش‌بینی نتایج نامطلوب در بیماران عمل کند. هدف‌گذاری بر روی این ژن‌ها و مسیرهای مرتبط ممکن است راهکارهای درمانی جدیدی برای مدیریت سرطان پروستات ارائه دهد.</span></span></span></span></span></span></span></div> <div class="rounded" style="background: rgb(255, 218, 224); border: 1px solid rgb(250, 115, 115); padding: 5px 10px; text-align: justify;"><span style="font-size:14px;"><span style="font-family:Tahoma;"><span style="line-height:2;"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span style="color:#fe2e9a"><span style="letter-spacing:.15pt">Background and Objective:</span></span></b> <span style="color:#1f1f1f">Prostate cancer is one of the most common cancers in males, with 1,466,680 new cases reported in 2022, making it the fourth most prevalent cancer. This disease is observed to have a higher incidence and mortality rate among African-American males, compared to other races. This study aimed to investigate the differential gene expression and identify prognostic biomarkers in prostate cancer. The main objectives of this research included the identification of differential genes in prostate cancer, determining the biological processes and signaling pathways associated with tumorigenesis, and demonstrating genes related to poor prognosis in patients with this disease.<b> </b></span></span></span><br> <span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span style="color:#fe2e9a"><span style="letter-spacing:-.2pt">Materials and Methods:</span></span></b> <span style="color:#1f1f1f">This study used bioinformatics to analyze the RNA sequencing dataset with the identifier code GSE104131. High-grade prostate tumor samples and adjacent healthy tissue samples were collected from 16 patients (8 African-American men and 8 European-American men). Differential genes were identified using the GEO2R tool. A protein-protein interaction network was also established to identify hub genes and examine their roles in patient prognosis. </span></span></span><br> <span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span style="color:#fe2e9a"><span style="letter-spacing:-.2pt">Results:</span></span></b> <span style="color:#1f1f1f">Results indicated that 534 differential genes were identified, 320 and 214 of which were upregulated and downregulated, respectively. Analyses revealed that increased expressions of GATA6 and ABCC4 genes are associated with poor prognosis in patients with prostate adenocarcinoma. Furthermore, signaling pathways, such as &quot;biological oxidation&quot; and &quot;insulin secretion&quot; were significantly involved in the progression of prostate cancer. </span></span></span><br> <span style="unicode-bidi:embed"><span style="color:black"><b><span style="color:#fe2e9a"><span style="letter-spacing:-.1pt">Conclusion:</span></span></b> <span style="color:#1f1f1f">The simultaneous increase in the expressions of GATA6 and ABCC4 may serve as key biomarkers for the prediction of adverse outcomes in patients. Targeting these genes and related pathways could provide new therapeutic strategies for the management of prostate cancer.</span></span></span></span></span></span></div> سرطان پروستات, بیومارکر, پیش‌آگهی Biomarker, Prognosis, Prostate cancer 36 44 http://urology.umsha.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3453-1&slc_lang=fa&sid=1 Amir Taherkhani امیر طاهرخانی amir.007.taherkhani@gmail.com 10031947532846004559 10031947532846004559 No Research Center for Molecular Medicine, Institute of Cancer, Avicenna Health Research Institute, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی، پژوهشکده سرطان، پژوهشگاه سلامت ابن سینا، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران Maede Mohseni مائده محسنی mao.mohseni@gmail.com 10031947532846004560 10031947532846004560 Yes Urology and Nephrology Research Center, Avicenna Institute of Clinical Sciences, Avicenna Health Research Institute, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran مرکز تحقیقات اورولوژی و نفرولوژی، پژوهشکده علوم بالینی ابن سینا، پژوهشگاه سلامت ابن سینا، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران